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西安百螢生物科技有限公司 主營:百螢生物圍繞熒光發(fā)光、熒光標記、熒光探針等技術(shù)進行產(chǎn)品研發(fā),公司產(chǎn)品廣泛用于核酸蛋白定量、細胞凋亡研究、細胞信號通路研究、細胞及線粒體膜電位檢測、細胞器染色、活體示蹤、抗體標記等科研領(lǐng)域。
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技術(shù)文章

你不知道的DNA探針(二)

上期百螢生物帶您了解了四種市場常見的熒光探針,本期我們將給您介紹其他幾種市場常見的DNA探針,希望對您的實驗有所幫助。

 

DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)(Key:藍色熒光、AT序列偏好、熒光顯微鏡、微滲透、細胞毒性、無毒)

DAPI,與此列表中的許多染料一樣,*初合成為醫(yī)學(xué)劑。它*初用于**錐蟲病,這是一種由寄生蟲引起的**。在20世紀70年代后期,DAPI被用作DNA探針,因為它具有結(jié)合DNA的功效和結(jié)合后熒光的大量增加。DAPI特別強烈地結(jié)合雙鏈DNA的富含AT的區(qū)域,并且在結(jié)合時將經(jīng)歷大約20倍的熒光增加。它也可以與RNA結(jié)合,但熒光增加較弱,發(fā)射紅移。DAPI通常用于熒光顯微鏡。它特別成功地染色死細胞或具有受損膜的細胞。DAPI可以通過完整的細胞膜,但是比較困難。因此,不推薦用于活細胞染色。DAPI的激發(fā)波長為358nm,發(fā)射波長為461nm。這意味著當使用藍色/青色濾鏡進行可視化時,它將顯示為藍色。它也可以與綠色熒光探針如GFP一起使用。

在實驗中,DAPI具有高細胞毒性,這是不可使用DAPI進行活細胞染色的另一原因。DAPI對人類是無毒的。然而,與許多DNA探針一樣,DAPI可能具有一些誘變特性。該試劑百螢生物有售,見貨號Cat#17509。

 

7-AAD(7-氨基放線菌素D)(Key:GC序列偏好、紅色熒光、543nm氦 - 氖激光、死細胞、不可滲透、熒光顯微鏡、流式細胞術(shù))

7-AAD是熒光探針和嵌入劑。與DAPI一樣,它對結(jié)合雙鏈DNA具有很強的親和力。與富含AT的區(qū)域結(jié)合的DAPI不同,7-AAD選擇性地結(jié)合富含GC的區(qū)域。它也會與RNA結(jié)合,因此在染色前可能需要消化酶。7-AAD的激發(fā)波長為546nm,發(fā)射波長為647nm。由于斯托克斯大轉(zhuǎn)變,許多研究人員使用7-AAD與藍色和綠色熒光探針結(jié)合進行多色分析。7-AAD受到543 nm氦氖激光器的激發(fā)。

7-AAD適用于檢測死細胞群或具有受損膜的細胞。它不容易通過完整的膜,是它不能成為活細胞染料的重要原因。7-AAD已在熒光顯微鏡和流式細胞術(shù)中得到廣泛應(yīng)用。該試劑百螢生物有售,見貨號Cat#17501。

 

Hoechst 33258(33342,34580)Key:藍色熒光、活細胞、膜可滲透、低細胞毒性、AT序列偏好、氙汞燈、紫外激光、熒光顯微鏡、流式細胞儀)

Hoechst染色是一組藍色熒光DNA探針。早在20世紀70年代,它們就被用于染色DNA。這些染料由德國公司Hoechst AG開發(fā),是傳統(tǒng)藍色熒光染料的良好替代品。Hoechst染料比類似染料如DAPI具有更高的細胞滲透性。這意味著Hoechst染色劑,如Hoechst 33258,適用于染色活細胞和死細胞。此外,由于Hoechst染料的細胞毒性較低,對活細胞群的影響大大降低。Hoechst染色將選擇性地結(jié)合富含AT的雙鏈DNA區(qū)域,特別是與小溝結(jié)合。在與DNA結(jié)合后,Hoechst染色將經(jīng)歷大約30倍的熒光增加。Hoechst染色可以被紫外線(~360nm)激發(fā)并發(fā)出藍色熒光(~460nm)。這些染料與氙汞燈以及紫外激光器兼容。它們非常適用于熒光顯微鏡,**組織化學(xué)和流式細胞術(shù)。

Hoechst 33258,33342和34580之間的區(qū)別很重要。與Hoechst 33258相比,Hoechst 33342由于添加了親脂性乙基而具有顯著更高的滲透性。對于Hoechst 34580,發(fā)射*大值略微藍移,與Hoechst 33258和Hoechst 33342的461 nm發(fā)射*大值相比,駐留在437 nm處。該試劑百螢生物有售,見貨號Cat#17523。

 

PicoGreen®/ Helixyte?(Key:高成本,極其敏感,綠色熒光,PCR,酶標儀,dsDNA)

PicoGreen(及其化學(xué)等效的Helixyte)是一種極其敏感的雙鏈DNA探針。它可用于生物化學(xué)應(yīng)用,例如酶標儀中dsDNA的定量。它可以檢測低至25 ng / mL的dsDNA。這使得它比Hoechst探針更敏感。除了靈敏度之外,PicoGreen還是一種非常有選擇性的探針。它對單鏈DNA,RNA和游離核苷酸的dsDNA具有高親和力。

顧名思義,PicoGreen在與DNA結(jié)合時會發(fā)出綠色熒光。它的熒光也會增加大約1000倍。這意味著它將具有非常好的信噪比。它可用于各種應(yīng)用,例如PCR和微陣列分析。它是DAPI和Hoechst的良好替代品。特別是,當DNA樣品數(shù)量有限時,由于其對傳統(tǒng)污漬的敏感性和選擇性更高,因此非常適用。然而,這些優(yōu)勢是有代價的。探針本身比傳統(tǒng)探針更昂貴,每毫升花費幾百美元。該試劑百螢生物有售,見貨號Cat#17597。

 

YOYO®-1 / DiYO?-1 /TOTO®-1 / DiTO?-1(Key:極其敏感、高成本、不滲透、流式細胞儀、細胞活力、花菁、綠色熒光)

這些是基于化合物惡唑黃的菁染料家族。盡管如此,這些染料實際上發(fā)出的是綠色熒光而不是黃色熒光。例如,YOYO-1(及其化學(xué)當量,DiYO-1)的*大發(fā)射為509nm。TOTO-1(及其化學(xué)當量,DiTO-1)也是如此; 該化合物的*大發(fā)射為535nm。這些化合物是嵌入劑,意味著它們將自身插入DNA堿基對的平面表面之間。該DNA探針家族因其對DNA的高親和力而被人們所知曉。在與DNA結(jié)合后,這些探針可以經(jīng)歷熒光增加一千至三千倍。這種對DNA的強烈親和力使它們非常適合需要極高靈敏度的實驗。然而,這些探針相當昂貴。一毫升可能花費幾千美元。

因為這些探針是細胞不可滲透的,所以它們不能通過完整的細胞膜。它們非常適合染色固定或死細胞。在這方面,這些探針通常與諸如流式細胞術(shù)的平臺一起用于細胞活力和細胞毒性測定。該試劑百螢生物有售,見貨號Cat#17580。

 

SYBR®(Key:綠色熒光,qPCR,凝膠電泳,高成本,花青)

SYBR是另一類基于花青的染料,用于染色DNA和RNA。該染料家族對雙鏈DNA具有高選擇性,對單鏈DNA和RNA的選擇性較低。SYBR染料主要是綠色熒光探針(SYBR Green I和SYBR Green II),也可選擇黃色熒光(SYBR Gold)。

SYBR染料已被發(fā)現(xiàn)用于量化DNA。例如,SYBR染料可用于監(jiān)測定量實時PRC(qPCR)。SYBR染料也已用于凝膠電泳。特別是,SYBR染料作為常用的溴化乙錠的更**的替代品已被出售。然而,關(guān)于SYBR染料是否確實比溴化乙錠更不危險的證據(jù)是混合的,因為它們都是潛在的誘變劑,源于它們插入DNA的能力。在定價方面,SYBR染料比溴化乙錠貴得多,每毫升約500美元。該試劑百螢生物有它的同等替代品,見貨號Cat#17592。

 

百螢生物,是美國AAT Bioquest 的中國代理商,原裝進口的產(chǎn)品,給您*佳的科研體驗。以上是本期介紹的所有DNA探針,希望大家根據(jù)自己的實際情況選擇適合自己試驗的試劑,達到上乘的實驗效果。

 

 

 

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